Als eigener Nachwuchsspieler spielte er seit seiner Jugend bis zum Jahr 1962 für die SSVg Velbert. Zwischen 1962 und 1965 kickte er für Preußen Münster – zunächst noch in der Oberliga West, bis 1964 dann auch in der ein Jahr zuvor neu geschaffenen Bundesliga. Sepp Herberger nominierte ihn im November 1963 für die deutsche Amateur-Nationalelf, in der unter anderem die bekannten Profis Horst Dieter Hötges und Rudi Brunnenmeier spielten.
Von 1966 bis 1974 bestritt er für die Fortuna aus Düsseldorf 260 Pflichtspiele, davon drei Jahre als Mannschaftskapitän der Fortuna. Werner Lungwitz war bis zuletzt ein großer Fan des Velberter Fußballclubs und ein gern gesehener Gast bei den Spielen der 1. Mannschaft.
Der Verein sowie die Mitglieder von Vorstand und Verwaltungsrat werden ihn ehrenvoll in Erinnerung behalten. „Auch für die Sportstadt Velbert ist der Tod von Werner Lungwitz ein schmerzlicher Verlust“, betonte auch Bürgermeister Dirk Lukrafka in einem Telefonat mit dem 1. Vorsitzender Oliver Kuhn.