Juan Riquelme hatte die Boca Juniors in der 44. Minute mit 1:0 nach vorne gebracht, im zweiten Durchgang trafen Martin Palermo (54.) und Sebastian Battaglia (83.) für die Argentinier.
Im Kampf um den Titel wartet nun Gremio Porto Alegre, das sich im zweiten rein brasilianischen Halbfinale gegen den FC Santos mit Zé Roberto durchgesetzt hatte. Die beiden Finalspiele finden am 13. und 20. Juni statt, Gremio Porto Alegre muss dabei zunächst auswärts antreten.