Der gebürtige Kölner Ruthenbeck trainierte in der 2. Liga von 2013 bis 2015 den VfR Aalen und danach bis November 2016 die SpVgg Greuther Fürth.
"Für mich ist die neue Herausforderung nach meiner Zweitligazeit kein Rückschritt in meiner Trainerkarriere", sagte Ruthenbeck. "Ich habe mich ganz bewusst für dieses spannende Projekt entschieden, junge Talente an den Profibereich heranzuführen. Köln ist meine Heimat und es ist etwas Besonderes für mich, dass sich der FC so intensiv um mich bemüht hat."
Ruthenbeck folgt bei der in der Junioren-Bundesliga spielenden U19 auf Boris Schommers, der den Verein am Saisonende verlassen wird.