Im Viertelfinal-Rückspiel bei Athletic Bilbao kam der DFB-Pokalsieger genau ein Jahr nach seinem grandiosen 5:2 beim damaligen Champions-League-Sieger Inter Mailand nur zu einem 2:2 (1:1) und verpasste nach dem 2:4 im Hinspiel das Halbfinale.
Die Königsblauen waren durch den 42. Saisontreffer von Klaas-Jan Huntelaar zunächst 1:0 (29.) in Führung gegangen, der eingewechselte Ibai traf (41.) aber noch vor der Pause mit einem Sonntagsschuss zum Pausenstand. Im zweiten Durchgang ließ der spanische 04-Kapitän Raúl (52.), der im Hinspiel beide Schalker Treffer erzielt hatte, die rund 3000 mitgereisten Schalke-Fans noch einmal hoffen, ehe Susaeta (55.) aus abseitsverdächtiger Position wieder die Spanier jubeln ließ.
Die Schalker spielten trotz der fast aussichtslosen Situation von Beginn an mutig nach vorne und hatte durch ihren Torjäger Huntelaar schon nach zehn Minuten eine vielversprechende Möglichkeit. Die Gastgeber traten mit dem Vorsprung im Rücken vor 40.000 Zuschauern im ausverkauften Stadion ihrerseits selbstbewusst auf, ließen vor dem Schalker Tor aber zunächst die letzte Konsequenz vermissen.
Die Gäste, die auf den Tag genau ein Jahr zuvor durch den Triumph bei Inter Mailand im Viertelfinale der Köningklasse für einen Sternstunde des deutschen Fußballs gesorgt hatten, standen defensiv sehr gut. Bilbao stellte die 04-Abwehr selten vor Probleme. In der 29. Minute leistete sich dann die Hintermannschaft von Bilbao in Person von Ander Herrera einen folgenschweren Patzer, den Huntelaar zu seinem 14. Treffer in der laufenden Europa-League-Saison, einschließlich Qualifikation, ausnutzte.
Schalke machte anschließend weiter Druck, zwingende Torchancen gab es vor der Pause aber nicht mehr. Ibai nutzte dann die erste klare Möglichkeit der Hausherren zum Ausgleich.
Nach der Pause ließ sich der achtmalige spanische Meister, der im Achtelfinale den englischen Rekordchampion Manchester United ausgeschaltet hatte, zunächst nicht aus der Reserve locken und ließ dem Tabellendritten der Bundesliga kaum Entfaltungsmöglichkeiten. Bilbao hatte aber erneut die Rechnung ohne Raúl gemacht, der mit seinem 77. Europacup-Treffer kurzfristig noch einmal die Hoffnungen der Schalker hoch hielt. Fast im Gegenzug erstickte dann Susaeta aber die Jubelschreie der Gästefans. Anschließend konnte der UEFA-Cup-Sieger von 1997, der sich nun in der Meisterschaft ganz auf den Kampf um Platz drei konzentrieren kann, Bilbao nicht mehr in Verlegenheit bringen.
Schalkes Trainer Huub Stevens hatte in seiner Startformation mit einer Überraschung aufgewartet. Für den angeschlagenen Jefferson Farfán, der nach einer Stunde eingewechselt wurde, spielte erstmals nach seiner Rückkehr vom FSV Mainz Tim Hoogland von Beginn an. Er sah beim 1:1 jedoch nicht sonderlich gut aus. Der lange verletzte Verteidiger hatte in dieser Saison nur einen Kurzeinsatz beim 0:3 bei Borussia Mönchengladbach am 11. Februar.
Vor dem Anstoß hatte Raúl, der in seinem 161. und möglicherweise letztem Europacupspiel neben Huntelaar bester Schalker war, vor der Arena Blumen niedergelegt. Traditionell ehrt der Kapitän des Gastmannschaft damits Rafael Moreno Aranzadi, genannt Pichichi, den ersten Torschützen im San Mamés, dem ältestes Stadion Spaniens (1913).