Die Schalker verloren in der turbulenten zweiten Halbzeit allerdings Nationalstürmer Gerald Asamoah durch eine Rote Karte (75.) wegen groben Foulspiels. "Das war der erste Schritt, aber am Samstag haben wir wieder ein wichtiges Spiel. Das war ein richtiges Pokalspiel, wir haben taktisch gut gestanden", sagte Schalke-Coach Fred Rutten und blickte bereits auf den Rückrunden-Auftakt bei Hannover 96 am Samstag. "Wir haben das Spiel immer kontrolliert. Das war eine sichere Sache", ergänzte Schalke-Keeper Manuel Neuer.
Bereits in der 19. Minute brachte der 24-jährige Peruaner Farfan die Gäste mit einem Traumtor per Hacke in Führung. Der viermalige DFB-Pokalsieger Schalke zeigte vor 17.600 Zuschauern im ausverkauften Ernst-Abbe-Sportfeld dann allerdings keine berauschende Vorstellung, musste im zweiten Abschnitt phasenweise sogar zittern.
Erst in der 66. Minute erzielte Farfan nach bangen Minuten das erlösende zweite Schalker Tor. Jena schöpfte aber nur Sekunden später durch den Anschlusstreffer des drei Minuten zuvor eingewechselten Andre Schembri noch einmal Hoffnung. Doch Rakitic machte mit einem direkten Freistoß in der 71. Minute alles klar. Der Mittelfeldspieler hatte auch das 1:0 vorbereitet. Den Schlusspunkt setzte Kevin Kuranyi in der Nachspielzeit. Die Gäste - in der Champions League und im UEFA-Cup bereits ausgeschieden - sind mit dem Weiterkommen 908.533 Euro reicher.
Die Runde der besten Acht, dort ist Schalke erstmals seit der Saison 2004/05 wieder dabei, wird am 3. März ausgetragen. Nach der Pause drängte der viermalige DDR-Pokalsieger auf den Ausgleich. Erst klärte Keeper Manuel Neuer vor dem glänzend von Torsten Ziegner freigespielten Carsten Sträßer (51.), dann ließ Neuer in der 53. Minute eine Eingabe von Amadeus Wallschläger fallen, Hähnge stocherte aber vergeblich nach dem Ball. In der ersten Halbzeit hatte es auf rutschigem Rasen wenig unterhaltsame Szenen gegeben.
Farfan köpfte in der zwölften Minute aus rund zehn Metern auf den Jenaer Kasten, Carsten Nulle hielt aber sicher. Nach der Führung zogen sich die Gäste zurück. Zweitliga-Absteiger Jena erarbeitete sich aber kaum Chancen und brachte selbst mehrere Freistöße nicht in die Gefahrenzone. In der 31. Minute verhinderte Nulle bei einem Flachschuss von Kapitän Marcelo Bordon einen weiteren Gegentreffer. Erst danach kam Jena doch noch zu einer großen Torchance: Sebastian Hähnge köpfte nach einem Eckball an die Latte. Bei den Gästen nahm Stürmer Kuranyi zunächst auf der Ersatzbank Platz. Der 26-Jährige litt zuletzt unter Patellasehnenproblemen, ein Einsatz von Beginn an wäre für ihn noch zu früh gekommen.